B1: Microbiologia
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Il microbioma vegetale svolge un ruolo importante nella salute, nello sviluppo e nella resa delle piante. In particolare, i batteri associati alle radici (rizosfera ed endobatteri delle radici) e i funghi micorrizici arbuscoli (AMF) svolgono un ruolo centrale nell'assorbimento dei nutrienti e nella protezione delle piante. In condizioni di stress da siccità, l'importanza di queste proprietà positive del microbiota associato alle radici aumenta notevolmente. Oltre alla disposizione genetica, la resistenza alle malattie delle piante è determinata principalmente dal microbioma associato alle piante e dal microbioma del suolo. In generale, si osserva una correlazione positiva tra diversità microbica/abbondanza di AMF e salute delle radici.
La composizione del microbioma nelle e sulle radici è controllata e promossa dagli essudati radicali delle piante. Popolazioni vegetali diverse producono essudati diversi e quindi microbiomi diversi. Nei popolamenti misti, ci si aspetta una maggiore abbondanza e diversità batterica e di AMF nel suolo. La misura in cui questo ha un effetto positivo sulla salute delle piante non è ancora stata studiata. Oltre alla diversità delle comunità batteriche, è particolarmente importante comprendere l'attività di specifici gruppi microbici che contribuiscono, ad esempio, all'efficiente apporto di nutrienti alle piante. Il ruolo di queste comunità è particolarmente importante nel caso delle specie di Fusarium, che sono per lo più patogeni opportunisti che sono asintomatici nelle piante e poi causano danni quando le piante sono stressate. Il Fusarium è associato a diverse nicchie ecologiche. Mentre le specie di Fusarium associate alle radici e ai semi di grano sono ben caratterizzate, mancano informazioni sulle specie di Fusarium associate alle piante medicinali e aromatiche.
Pacchetti di lavoro e partecipanti
WP 1: Analisi biologica micro e molecolare del microbioma vegetale
WP 2: Analisi biologica micro- e molecolare del patobioma con particolare attenzione ai patogeni Fusarium nelle radici e nei semi
